查克拉的出现，使忍者活跃于战场，在其后若干年的战斗中确立了在战场上的主导地位，由此脱离了低贱的地位。
若干年后，无数人杰前赴后继，投入到忍者这一体系中加以完善，使这个世界的忍者才得以拥有如此巨大的影响。尽管如此，这也是一个拼爹的世界，血统决定着忍者的前途和器量，也许有着各种各样的人才不甘心于此，但大都于半途夭折，尸骨无存。
一个年轻人，一个学者，来到了这个多姿多彩的世界，重生为奈良鹿丸这个原著中武力平平的配角，这是否能够阻挡着一个男人欲蹬往顶峰的动力呢？